奥密克戎有263种亚变体！为什么奥密克戎的变异次数格外之多？
新冠病毒究竟发生了多少次变异？为什么奥密克戎的变异次数格外之多？病毒又朝着什么方向发生变异？
现在全球疫情最严重的地方是哪里？
答案不是美国，而是日本，上周7天新增病例133万例，位居全球第一。
而奥密克戎病毒株BA.5是导致日本新冠疫情快速恶化的首要因素。
根据世界卫生组织（以下简称世卫组织）7月20日发布的最新报告，在7月4日至10日， BA.5的全球占比进一步提升，从51.84%增加至53.59%，并且已扩散至全球100个国家。
粗略地算，这是引发大感染的第三波奥密克戎。奥密克戎于去年11月在南非首次出现，之后席卷了整个世界，并推翻了它的前身“德尔塔”。第二波奥密克戎则是BA.2，这导致了今年年初的一波疫情。而BA.5则是新一代的“病毒之王”。
不过，病毒的进化并没有停止。
新亚变体BA.2.75已经成功引起世卫组织的注意，成为被监测的变体之一。这一毒株由BA.2进化而来，截至7月18日，已有15个国家报告发现感染BA.2.75的患者。并且，在印度部分省份，BA.2.75的占比已超过BA.5。
新冠病毒究竟发生了多少次变异？为什么奥密克戎的变异次数格外之多？病毒又朝着什么方向发生变异？
超过2000种亚型或分支
要说明白这个问题，先来快速了解下病毒的命名规则。
大众最为熟知的是由世卫组织命名的5种需要关注的变异毒株（VOC），包括早期出现的Alpha、Beta、Gamma，以及具有较大影响力的Delta和Omicron。
除了VOC外，世卫组织也根据病毒的潜在特性与影响力，标注出8支需要留意的变异毒株（VOI）。
而BA.X这种命名的方法，则是一种叫Pango的命名方法，命名规则是，前面的英文字母代表属于某一个支系，后面的点和数字代表来源于前面支系的第几个子代分支。当某一个支系后面的数字超过3个时，将产生一个新的字母支系。如B.1.1.1的下一个子代支系不叫B.1.1.1.1，而是生成一个新的支系C支系，命名为C1。
另一种比较常用的命名方式Nextstrain，则是以年份开头，后续依次按照字母顺序来命名变异株，如B.1.1.7在Nextstrain命名规则中命名为“20I(V1)”。
他们的对应方式如下：
以德尔塔（Delta）为例，它的Pango命名为B.1.617.2，在德尔塔的支系下，一共衍生出133个子代分支，有数个分支又延续出第四代分支，因此共计244种变异毒株。
从2019年的原始毒株，到目前流行的BA.5，新冠病毒已发生了近千次变异，据不完全统计，在Pango命名法中，全球记录在内的新冠病毒已有2023种。
并不是所有毒株都具有较大的影响力，大部分的亚型毒株仅局限于特定地区，感染人数也较少。
因此，另一种名叫Nextstrain的命名方式，研究者添加了三个条件，以重点观察那些具有危险性的变异毒株。
这三个条件包括：（1）在全球流行超过2个月且比例超过本时期流行株总数的20%以上；（2）在某个地区流行超过2个月且比例高于本地区同时期流行毒株的30%；（3）出现引起公共卫生风险的变异。满足任意一个条件，即可添加一个新的支系。
截至2022年7月27日，Nextstrain命名方式记录了28支变异毒株，部分与世卫组织的标签重合。这些毒株都曾在全球或一些地区流行，造成一定影响。
变异频率逐渐加快
进入奥密克戎时期后，新冠病毒的变异频率有所提高。
根据国家生物信息中心的研究数据，在2020年初，病毒变异频率的中位数（下简称为频率中位数）处于低位，最低时为千分之0.05；在2021年年初，频率中位数突破千分之一；而在2021年底至2022年初，随着奥密克戎的出现，频率中位数再次突破峰值，达到千分之二。
目前，截至7月21日，频率中位数为千分之2.53，且依旧处于上升阶段。
从基因变异位点来看，随着疫情的发展，新冠病毒基因组位置变化的频率也在不断增加。
根据国家生物信息中心的研究数据，在2022年后，基因组位置发生变异情况的频率大大增加，例如28461点位，其变异频率从2020年的0，逐步增加至2022年7月的90%。
具体来看奥密克戎的情况。
前文提到，德尔塔共产生244种变异毒株，而从支系的数量来看，奥密克戎变异毒株才是最善变的。
奥密克戎最初的Pango命名为“B.1.1.529”，而后随着基因的突变，逐渐演变出5个子代分支，包括BA.1、BA.2、BA.3、BA.4与BA.5。
而每个分支又分化出不同数量的支系，其中，BA.2分支的支系数量最多，共计120支；而BA.3的支系数量最少，仅有2支。
同时，BA.2也产生了数支较为危险的支系。
针对奥密克戎的变异情况，世卫组织基于变体的传播速度与其潜在影响力，将7个支系列为监测对象，而有5支都为BA.2分支，包括前文提到的BA.2.75。
不仅如此，BA.1与BA.2还通过重组的方式，产生了28种新毒株，例如今年年初在英国流行的XE与XF，以及在丹麦流行的XH、在芬兰流行的XJ等。
据不完全统计，截至7月27日，奥密克戎所有亚型毒株的数量为263支，并且还在增多。
为什么病毒变异的速度会加快呢？
天津大学生命科学学院教授王涛表示，新冠病毒是RNA病毒。这类病毒的结构不稳定，在自身复制的过程中，不会清除掉突变基因，导致突变基因不断累积，病毒不断变异。
另一方面，奥密克戎变异频率的提高，与其特性有关。
相比于此前的变异毒株，奥密克戎的毒性减弱，传播速度加快，这导致感染的人数激增，并且病毒在人体内存活的时间也被延长。因此病毒自我复制的次数增多，突变的概率也增大，出现亚变体的数量也就越多。
变异方向未知
从数据上来看，新冠病毒似乎呈现出传播力逐渐增强、病死率逐渐降低的发展趋势。
在R0值上，奥密克戎BA.1（9.5）已是原始毒株（3.3）的3倍之多，是德尔塔（5.1）的1.86倍。而奥密克戎亚变体的R0值更高，BA.2的R0值达到13.3，BA.4/BA.5的R0值更是达到18.6，是原始毒株的5.6倍之多。
相比于德尔塔，奥密克戎的重症风险较低。
根据加州大学伯克利分校公共卫生学院的研究报告，在确诊后三十天，奥密克戎BA.1在住院情况、重病程度、死亡风险上都远低于德尔塔。住院风险下降了40%，重病率是德尔塔的一半，而死亡的风险也仅为德尔塔的五分之一。
按这样的趋势发展，与新冠病毒共存指日可待？答案是否定的。
一方面，病毒免疫逃逸的能力似乎越来越强。
BA.5已具有较强的免疫逃逸能力，新亚变体BA.2.75的免疫逃逸能力似乎更强。
根据北京大学生物医学前沿创新中心的报告，整体上来看，BA.2.75的免疫逃逸能力没有超过BA.5，包括接种了三剂疫苗、接种三剂疫苗+感染过BA.1、接种了三剂疫苗+感染过BA.2。
但是，对于有德尔塔既往感染史的患者而言，BA.2.75并不是善茬，它的免疫逃逸能力强于BA.5，提高了1.5倍之多。
免疫逃逸能力的增强意味着患者将重复感染，而华盛顿大学（圣路易斯）流行病学家曾表示，多次感染者患重症或死亡的累积风险可能会更高。
以日本为例，日本目前的主流毒株为BA.5，但根据日本京都大学的消息，BA.2.75即将取而代之。
日本目前是全球疫情最严重的国家，单日新增病例数不断创新高。7月28日，日本单日新增病例数（7天平均数）已超过19万人，是此前峰值（2022年2月8日）的2.03倍，并且仍处于上升趋势。
尽管病死率目前尚未提高，但随着确诊人数的激增，死亡人数也在不断增加。
7月28日，日本单日（7天平均值）死亡人数约为80人，从6月中下旬开始，本轮疫情的死亡人数已累计达到1262人。并且，由于新冠死亡具有滞后性，死亡人数还将继续增加。
病毒并不会按照人们预设的轨道发展，变异方向仍不明确，现在还不是可以放松的时刻。
目前，我国疫情总体处于低水平波动状态，但防控形势严峻复杂，仍然需要严格执行第九版防控方案和“九不准”要求，坚持“外防输入、内防反弹”，坚持“动态清零”。
编辑：涵雨
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